Equipements ISOMer

Le laboratoire ISOMer développe des recherches pluridisciplinaires sur les organismes marins des milieux côtiers et estuariens, sur leurs environnements, leur physiologie et sur les métabolites qu’ils produisent. En plus d’équipements de laboratoire classiques, ISOMer est équipé des ressources ci-dessous. Ces équipements ont été acquis grâce à des financements de la région Pays de la Loire, du Fond Européen de Développement Régional (FEDER PL0022979) et de l'ANR.

Plateau d’analyses métabolomiques Thalassomics

• Plateau de système chromatographie liquide analytique : 3 HPLC-UV (Agilent) - Région PDL
• UHPLC couplée à une trappe d’ion (LTQ-XL Thermo) (UHPLC-ITMS) – Région PDL
• HPLC couplée à un spectromètre de masse hybride trappe d’ion et temps de vol (HPLC-IT-TOFMS Shimadzu) - Région PDL

• Système de chromatographie Flash - Région PDL
• Système HPLC semi-préparatif avec détection UV (Agilent) et coupable à de la spectrométrie de masse – ANR
• Système de chromatographie en phase gazeuse couplé à un spectromètre de masse (GC-MS - Agilent)

Equipement dédié à l’analyse du microphytobenthos

• Chambre expérimentale thermostatée à lumière controlée - FEDER

Cet équipement permet de réaliser des expériences d’écophysiologie mais également d’écotoxicologie, simulant les conditions environnementales de manière fidèle. Ainsi nous simulons les effets du changement climatique (e.g. augmentation de la température, modification des cycles émersion/immersion en raison de la remontée des eaux, modification du spectre lumineux en raison de l’augmentation de la turbidité de l’eau) et des pollutions diffuse et chronique (e.g. pollutions par les terres rares et les micro-plastiques) sur les compartiments aussi bien végétal (production primaire) qu'animal (les consommateurs).

• HPLC (Waters) – FEDER

La chaîne HPLC est dédiée à l’analyse pigmentaire des végétaux et des vasières afin de proposer des algorithmes de traitement des images satellites pour la cartographie de la biodiversité et de la production primaire des vasières littorales. Cet équipement primordial permet de répondre aux exigences spécifiques de nos échantillons à analyser dans le cadre de l'étude du cycle du Carbone : diversité, complexité, nouveauté.

• Système Fast Fluorescence Repetition Rate (PSI) with thermoregulator – Région PDL - FEDER

Un contrôleur de température a été adapté au fluorimètre afin de contrôler les procédés de production primaire des microalgues et d’éliminer des biais dans la mesure. Cette régulation de la température est primordiale dans le contexte actuel du réchauffement climatique. En effet, les espèces étudiées modifient leur production primaire avec la température. Nous sommes donc en mesure de prédire leurs comportements dans les années à venir, et les conséquences sur le fonctionnement des vasières littorales.

• ImagingPAM (Walz)
• Trois chambres de cultures
• Photobioréacteur Biofilm (Synoxis Algae) – Région PDL
• Centrifugeuse Thermo - FEDER

Cet équipement est essentiel pour la préparation des échantillons de terrain des vasières afin de séparer le sédiment des pigments, qui seront analysés par l’HPLC et le fluorimètre. Cette préparation est indispensable à l’élimination des impuretés et à assurer une durée de vie plus longue aux équipements scientifiques de la plate-forme.

• Spectroradiomètre de terrain Visible/Infrarouge (ADS) : Matrice 210 RTK DGI & capteur multispectral MicaSense Dual Sensor - FEDER

Cet équipement permet d’acquérir in situ des spectres de réflectance sur les vasières ou en mer et d’aborder les questions scientifiques concernant l’upscaling. Il permet de minimiser les erreurs et les incertitudes autour des traitements des images satellites afin de cartographier aux échelles régionale et globale (côtes Atlantiques Européennes et Nord-Américaines) la biodiversité littorale, sa biomasse et sa contribution au cycle du Carbone. ….

Equipements d’imagerie optique

• Microscope inversé
• Microscope à fluorescence

Equipements d’analyses biochimiques

• Spectrophotomètre Shimadzu UV1900
• Lecteur de microplaques Thermo Varioskan